医院等医疗机构使用的软件类别众多，医疗软件是一个大的概念，部分属于医疗器械，部分不属于医疗器械，所以，软件销售企业是否需要办理医疗器械经营许可证？

常见的医院管理信息系统，如HIS系统；医院物资进销存管理系统、人力资源管理系统等等，这些属于管理软件，不作为医疗器械管理，无需办理医疗器械经营许可证。

诊断远程咨询类软件，医药、医疗器械销售平台类软件，这类软件也不作为医疗器械管理。

治疗类软件、诊断类软件、医学图像传输处理类软件、医学数据传输处理类软件，此类按照医疗器械管理。目前，多数医疗软件属于第三类医疗器械，经营第三类医疗软件需要办理医疗器械经营许可证。也有相当一部分医疗软件属于第二类医疗器械，经营此类医疗器械需要办理第二类医疗器械经营备案凭证。