对于注册医疗器械公司来说与注册普通行业公司是不一样的，需要向当地管理部门申请医疗器械经营许可证，一般来说需要办理的流程如下：

流程一：需要到工商管理部门办理企业名称预先核准通知书。

流程二：去当地监督管理局网站提交网上申请材料。

流程三：网上材料审核通过后，当地的药监部门就会预约查看经营场地。

流程四：提交书面的有关申请材料，审核通过后就会颁发医疗器械经营企业许可证。

流程五：开设验资账户，股东们进行出资，会计事务所出具有关验资的报告。

流程六：办理营业执照。

流程七：去街上刻章准备经营。

流程八：去有关部门办理组织机构代码证。

流程九：去有关部门办理税务登记证。